Cruzain-IN-1是一种针对克鲁斯氏锥体虫半胱氨酸蛋白酶 (Cruzain)的抑制剂，通过共价结合实现高效抑制，为寄生虫病治疗提供了新的途径。

NSC 185058是一种ATG4B抑制剂，IC50为3.24 μM。

Calpeptin是一种强效的细胞透过性钙蛋白酶抑制剂，ID50 分别为 52 nM、34 nM、138 nM 和 40 nM，针对猪红细胞的 Calpain I、猪肾脏的 Calpain II、Papainb 及人血小板的 Calpain I。

E 64c是 E-64 的衍生物，是一种不可逆且能够透过膜的半胱氨酸蛋白酶抑制剂，能够抑制 MERS-CoV 的活性。

N-Ethylmaleimide是一种不可逆的半胱氨酸肽酶抑制剂，是一种来源于马来酸的有机化合物。

Leupeptin hemisulfate是一种可逆的丝氨酸/半胱氨酸蛋白酶抑制剂，抑制猫肽酶 B、H、L 和 S、钙调蛋白酶、以及胰蛋白酶。

LY 3000328是一种高度选择性且强效的 Cathepsin S (Cat S)抑制剂，IC50 分别为 7.7±5.85 nM 和 1.67±1.17 nM，适用于治疗腹主动脉瘤。

TPCK是一种非特异性不可逆的丝氨酸/半胱氨酸蛋白酶抑制剂。它通过在 Ras 报告分子的存在下抑制 ScRce1 作用，但在存在 a-因子肽时不抑制。

Balicatib是一种强效且选择性的猫hepsin K抑制剂，在细胞内酶占位试验中比cathepsin B、L和S的抑制活性强10-100倍。

Odanacatib是一种强效、选择性、中性的组织蛋白酶K（人/兔）抑制剂，其对人类组织蛋白酶K的IC50为0.2 nM，对兔组织蛋白酶K的IC50为1 nM。同时，Odanacatib对非靶点的组织蛋白酶B、L、S表现出高度的选择性

CA-074 methyl ester是一种特异性的半胱氨酸蛋白酶B抑制剂，具有神经保护、抗癌和抗炎等强效生物活性。

MG-101是一种强效的半胱氨酸蛋白酶抑制剂，包括 calpain I（Ki = 190 nM）、calpain II（Ki = 220 nM）、cathepsin B（Ki = 150 nM）和 cathepsin L（Ki = 500 pM）。

E-64（蛋白酶抑制剂E 64）是一种高效的不可逆广谱半胱氨酸蛋白酶抑制剂，对木瓜蛋白酶的IC50为9 nM。

E-64d（E64d）是一种细胞可渗透、不可逆的广谱半胱氨酸蛋白酶抑制剂，对MERS-CoV具有入侵阻断作用。

Cysteine Protease inhibitor hydrochloride是一种胱氨酸蛋白酶抑制剂。

PMSF是一种非选择性的丝氨酸/半胱氨酸蛋白酶抑制剂，也能阻止内源性大麻酰胺的代谢。

K777 is an irreversible inhibitor of cysteine protease inhibitor and a antagonist of CCR4.

PD 150606 is a selective, cell-permeable non-peptide calpain inhibitor (Ki values for ν and m-calpains are 0.21 and 0.37 μM respectively).

Cysteine protease inhibitor is an inhibitor of cysteine protease.