Tubastatin A HCl是一种强效和选择性的 HDAC6 抑制剂，在无细胞测定中 IC50 为 15 nM。它对所有其他同工酶的选择性高 1000 倍，除了 HDAC8，它对其的选择性高 57 倍。Tubastatin A HCl还抑制 HDAC10 和含金属 β-内酰胺酶结构域蛋白 2 (MBLAC2)。

CUDC-101是一种强效的HDAC、EGFR和HER2抑制剂，IC50值分别为4.4、2.4和15.7 nM。它是一种包含炔基的砌块化学探针，用于铜催化的偶联反应（CuAAc）。

Quisinostat 2HCl是一种第二代 HDAC 抑制剂，对 HDAC1 的 IC50 为 0.11 nM，适度抑制 HDAC2、4、10 和 11，对 HDAC3、5、8、9 的选择性超过 30 倍，广泛用于抗肿瘤研究。

Pracinostat是一种强效的泛 HDAC 抑制剂，IC50 为 40-140 nM，但对 HDAC6 和 III 型同工酶 SIRT1 无抑制活性，可诱导肿瘤细胞凋亡，应用于癌症研究。

PCI-34051是一种强效且选择性的 HDAC8 抑制剂，IC50 为 10 nM，对其他 HDAC 亚型具有 200 倍以上的选择性。

Droxinostat是一种组蛋白去乙酰化酶（HDAC3、HDAC6、HDAC8）抑制剂，IC50 分别为 16.9 μM、2.47 μM 和 1.46 μM，常用于肝细胞癌研究。

Abexinostat是一种新型的全谱 HDAC 抑制剂，主要靶向 HDAC1，Ki 值为 7 nM，对 HDACs 2、3、6、10具有适度效能，并且对 HDAC8具有超过 40 倍的选择性。

Ricolinostat (ACY-1215) 是一种有效且选择性的HDAC6抑制剂，IC50为5 nM。它还抑制HDAC1、HDAC2和HDAC3的IC50值分别为58 nM、48 nM和51 nM。

Citarinostat是一种选择性HDAC6抑制剂，IC50为4 nM。它还可以抑制HDAC3（IC50 = 76 nM）。

BRD73954是一种选择性抑制HDAC6和HDAC8的抑制剂，IC50值分别为36 nM和120 nM。

HPOB是一种高效、选择性的 HDAC6 抑制剂，IC50 为 56 nM，对其他 HDAC 的效力降低了 30 倍以上。HPOB 提高了 DNA 损伤抗癌活性分子在转化细胞中的有效性，但不阻断 HDAC6 的泛素结合活性。